Yozgat Valiliği bünyesinde aşağıdaki kurumlar bulunmaktadır: İl Göç İdaresi Müdürlüğü; İl Milli Eğitim Müdürlüğü; İl Emniyet Müdürlüğü; Aile, Çalışma ve Sosyal Hizmetler İl Müdürlüğü; Sosyal Güvenlik İl Müdürlüğü; İl Afet ve Acil Durum Müdürlüğü; İl Sağlık Müdürlüğü.