KBS (Kamu Harcama ve Muhasebe Bilişim Sistemi) ve BKMYBS (Bütünleşik Kamu Mali Yönetim Bilişim Sistemi) farklı ancak ilişkili sistemlerdir. KBS, merkezi yönetim kapsamındaki kamu idarelerinin personel ödemeleri, bütçe hazırlığı ve muhasebe işlemleri gibi mali yönetim süreçlerini yürüten bir sistemdir. BKMYBS ise, kamu mali yönetimi ile ilgili fonksiyonel süreçleri destekleyen, birbirleriyle etkileşimli çalışan ve gerekli durumlarda bilgi alışverişinde bulunan yazılımların oluşturduğu entegre sistemler bütünüdür. Bu sistem, KBS'nin de içinde bulunduğu daha geniş bir yapıdır.