Peynirler çeşitli faktörlere göre farklı sınıflandırma sistemlerine tabi tutulabilir. Başlıca sınıflandırma kriterleri şunlardır: 1. Sütün Kaynağı: İnek, keçi, koyun veya manda sütü gibi. 2. Dokusu: Sert (parmesan), yarı sert (cheddar), yarı yumuşak (mozzarella) ve yumuşak (brie, camembert) gibi. 3. Olgunlaşma Süresi: Genç (taze), orta olgun (kısmen olgunlaşmış) ve ekstra olgun (uzun süre olgunlaştırılmış). Diğer sınıflandırma yöntemleri ise üretim yöntemi, kullanılan starter kültürler ve peynirin rengi gibi özelliklere göre yapılır.