Gen ve allel arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Tanım: Gen, DNA'nın bir kişinin sahip olacağı genetik özelliklere karar veren parçasıdır. 2. Eşleşme: Genler çiftler halinde oluşmazken, alleller çiftler halinde bulunur. 3. Fenotip: Alleller, karşıt fenotipler üretir ve doğa ile tezat oluşturan zıt özellikler belirler. 4. Kalıtım: Genler, tüm insanlar için aynıdır, ancak bunların nasıl tezahür ettikleri alleller tarafından belirlenir.