Transformasyon ve transfeksiyon arasındaki temel farklar şunlardır: Konakçı hücre türü: Transformasyon, genellikle bakteri ve maya hücrelerine gen transferi için kullanılır. Transfeksiyon, genellikle memeli hücrelerine gen transferi için kullanılır. Kalıtsal değişiklik: Transformasyon, genlerde kalıtsal değişikliklere neden olur ve bu değişiklikler kalıcıdır. Transfeksiyon, geçici ifadeye veya genlerde kalıcı değişikliğe neden olabilir. Kullanım alanı: Transformasyon, klon bankalarının hazırlanmasında verimli bir teknik değildir. Transfeksiyon, rutin olarak büyük ölçekli protein sentezi sistemlerinde kullanılabilir.