FTIR spektrometresi, maddelerin kimyasal yapısını analiz etmek için kızılötesi (IR) ışınlarının absorpsiyonunu ölçerek çalışır. Çalışma prensibi şu aşamalardan oluşur: 1. Işık Kaynağı: Genişli bantlı kızılötesi ışık yayılır. 2. Interferometre: Işınlar, Michelson interferometresi aracılığıyla modüle edilir. 3. Numune: IR ışığı, numune ile etkileştirilir; belirli frekanstaki ışıklar emilir. 4. Dedektör: Geçen ışığı algılar. 5. Fourier Dönüşümü: Toplanan interferogram, bilgisayar tarafından spektruma dönüştürülür. Bu analiz sonucu elde edilen spektrum, maddenin yapısal parmak izi gibidir ve kimyasal bileşimini belirlemek için kullanılır.