Sinestezinin nedenleri tam olarak anlaşılmamış olsa da, birkaç olası açıklama öne sürülmüştür: 1. Genetik Faktörler: Sinestezi, genetik bir bileşene sahip olabilir ve aile içinde sinestezi öyküsü bulunan bireylerde daha sık rastlandığı gözlemlenmiştir. 2. Nörolojik Yapılar: Beyindeki duyusal alanlar arasındaki aşırı bağlantılar veya çapraz bağlantılar, sinesteziye yol açabilir. 3. Beyin Kimyası ve Sinirsel Aktivite: Sinestezi, nörotransmitterlerin ve beyin kimyasının duyusal bilgi işleme üzerindeki etkilerinden kaynaklanabilir. 4. Gelişimsel Faktörler: Beyin gelişimi sırasında meydana gelen bazı anormallikler veya aşırı duyusal entegrasyon sinestetik algıların oluşumuna neden olabilir. 5. Çevresel ve Psikolojik Etkiler: Belirli eğitimler veya yoğun duyusal deneyimler sinestetik algıyı tetikleyebilir.