Sultan Melikşah döneminde Büyük Selçuklu Devleti, aşağıdaki yönetim anlayışıyla yönetilmiştir: Merkezî Otorite: Melikşah, merkezden atadığı melik, emir ve komutanlar aracılığıyla otoriteyi güçlendirmiştir. Feodal Anlayış: Melikşah, Selçuklu hanedanından olanlara toprak vererek birinci dereceden vasal devletler oluşturmuş, ayrıca fethedilen bölgelere merkezden valiler atamıştır. Askeri Teşkilat: Melikşah, profesyonel bir orduya sahip olup, bu ordu gulam adı verilen kölemenler ve paralı askerlerden oluşmuştur. Bürokrasi: Melikşah'ın vezirliği, babası zamanında vezirlik makamına getirilen Nizamülmülk yürütmüştür. Kültürel ve Bilimsel Destek: Melikşah, alim ve şairleri korumuş, Bağdat'ta Sultan Melikşah Camii'ni ve İsfahan'da bir rasathaneyi inşa ettirmiştir. Toprak Düzenlemeleri: 1074'te Celalî takvimini hazırlatmıştır. Melikşah'ın hükümdarlığı, Büyük Selçuklu Devleti'nin en parlak dönemi olarak kabul edilir.