Prokaryotlarda zarlı organeller, metabolik süreçlerin sitoplazmada gerçekleşmesi ve daha yüksek bir yüzey-hacim oranına ihtiyaç duyulması nedeniyle yoktur. Sitoplazmada metabolizma: Prokaryotlar, organellerde yapılan işlemleri sitoplazmada enzimler aracılığıyla daha hızlı gerçekleştirir. Yüzey-hacim oranı: Zarlı organeller, mevcut yüzey alanını azaltarak hücrenin çevresiyle madde alışverişi yapma yeteneğini sınırlar. Ayrıca, zara bağlı organellerin varlığı, gen ifadesi ve DNA replikasyonunun koordinasyonunu zorlaştırır.