Arkeler, prokaryot hücre düzenine sahiptir. Arkelerin bazı prokaryot özellikleri: Çekirdek ve zarlı organel bulunmaz. Hücre zarı, hücre duvarı, sitoplazma, ribozom ve nükleotid (DNA) ortak olarak bulunur. Bölünerek çoğalırlar. Arkelerin bazı ökaryot benzeri özellikleri: DNA paketleme, replikasyon ve gen ifadesi mekanizmaları ökaryotlara benzerlikler taşır. Moleküler biyolojide temel rolü olan genetik transkripsiyon ve translasyon mekanizmaları bakterilere pek benzemeyip, çoğu bakımdan ökaryotlara benzer. Ayrıca, arkeler kendi aralarında metanojenler, halofiller, aşırı termofiller ve soğuk sevenler olmak üzere dört gruba ayrılır.