Ökaryot ve prokaryot canlılar arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Hücre Yapısı: Ökaryot hücreler, karmaşık bir yapıya sahip olup, çekirdek ve zarla çevrili organeller içerir. 2. Genetik Materyal: Ökaryot hücrelerde genetik materyal, lineer DNA moleküllerinden oluşan kromozomlar halinde düzenlenmiştir. 3. Çoğalma Yöntemi: Ökaryot hücreler mitoz ve mayoz bölünme ile çoğalırken, prokaryot hücreler basit bir bölünme ile çoğalırlar. 4. Boyut: Ökaryot hücreler genellikle daha büyük (10-100 mikrometre) iken, prokaryot hücreler daha küçük (0.1-5 mikrometre) boyuttadır. 5. Metabolizma: Ökaryot hücreler karmaşık metabolizmalara sahipken, prokaryot hücreler daha basit ve çeşitli metabolizma yollarına sahiptir.