Nil Nehri'nin suyunun siyah olmasının nedeni, yıllık taşkınlarının kıyıları boyunca koyu renkli tortular biriktirmesidir. Ayrıca, Nil Nehri'nin "kara nehir" olarak anılmasını sağlayan bir diğer özellik de, uzun rotası boyunca kayalar, kayalar ve bitki artıklarından oluşan alüvyon getirmesidir.