Kalıtsal olmayan mutasyonlar, genlerin yapısında değil, işleyişinde meydana gelen değişikliklerdir ve sadece mutasyona uğramış bireyi etkiler. Kalıtsal olmayan mutasyonlara örnekler: 1. Sıcaklık: Himalaya tavşanlarında kürk renginin beyaz olması, ancak tüyler kazınarak buz parçası konulduğunda çıkan tüylerin siyah olması. 2. Besin: Dişi arıların arı sütü ile beslenmesi sonucu kraliçe arı, çiçek tozu (polen) ile beslenmesi sonucu işçi arılar oluşması. 3. Işık: Bitkiler ışık almadıklarında klorofil oluşmaz ve beyaz renkli (albino) bitki oluşur. 4. Basınç: Karahindiba bitkisinin dağda yetiştiğinde uzun boylu, ovada yetiştiğinde kısa boylu olması. 5. Asitlik (pH derecesi): Ortanca çiçeklerinin asidik toprakta mavi, bazik toprakta kırmızı çiçek açması.