Mitokondriyal DNA (mtDNA), hücrelerimizin çekirdeği haricinde, mitokondri denen ve enerji üretimi için büyük moleküllerin oksijen ile yakılarak küçük moleküllere dönüştüğü organelde bulunan bağımsız DNA parçasına verilen isimdir. Özellikleri: Yapı: Çift zincirden oluşmuş halkasal bir yapıya sahiptir. Boyut: 16.569 baz çiftinden oluşur. Gen Sayısı: 37 gen içerir; bu genlerin 13'ü protein, 22'si tRNA, 2'si ise rRNA üretimini kontrol eder. Kalıtım: Neredeyse her zaman sadece anneden, yani annenin soy hattından erkek ve dişi yavrulara aktarılır. Mutasyon Hızı: Nükleer DNA'ya göre daha yüksek bir mutasyon oranına sahiptir. mtDNA, soy, ırk ve filogenetik araştırmalarda, özellikle çağlar boyunca ırkların ve türlerin ne zaman ayrıldıklarını tahmin etmekte kullanılır.