Stereomikroskop (stereo mikroskop) ve bileşik mikroskop arasındaki temel farklar şunlardır: Büyütme: Bileşik mikroskoplar genellikle 40x ile 1.000x arasında büyütme sağlarken, stereo mikroskoplar 20x ile 80x arasında büyütme sunar. Kullanım Alanı: Bileşik mikroskoplar, yüksek büyütme gerektiren küçük numuneleri (örneğin, bakteriler veya hücre kesitleri) incelemek için kullanılırken, stereo mikroskoplar daha büyük, üç boyutlu ve opak nesneleri (örneğin, mineraller veya elektronik bileşenler) incelemek için uygundur. Görüntüleme: Bileşik mikroskoplar, iki boyutlu ve sanal bir görüntü oluştururken, stereo mikroskoplar üç boyutlu bir görünüm sağlar. Çalışma Mesafesi: Stereo mikroskoplar, 25 ila 150 milimetre arasında çok daha uzun bir çalışma mesafesine sahiptir, bu da kullanıcıya geniş bir hareket alanı sağlar. Her iki mikroskop türü de farklı uygulamalar için tasarlanmıştır; bileşik mikroskoplar daha yüksek büyütme ve çözünürlük sunarken, stereo mikroskoplar daha büyük nesnelerin üç boyutlu görüntülenmesi için idealdir.