Enerji akışı ve madde döngüsü ekosistemlerin temel işleyiş mekanizmalarını oluşturur. Enerji akışı: - Güneş, ekosistemlerin tek enerji kaynağıdır. - Güneş enerjisi, üreticiler tarafından fotosentez yoluyla kimyasal enerjiye dönüştürülür. - Bu enerji, besin zinciri boyunca otçullardan etçillere doğru tek yönlü olarak aktarılır. - Enerji dönüşümleri sırasında bir miktar enerji ısı olarak açığa çıkar. Madde döngüsü: - Yaşam için gerekli su ve diğer kimyasal maddeler Dünya'dan sağlanır. - İnorganik maddeler, cansız ortamdan alınarak canlı unsurlar arasında aktarılır ve tekrar cansız ortama verilir. - Başlıca madde döngüleri karbon, azot, oksijen ve su döngüsüdür.