Bakteri klonlaması, belirli bir DNA parçasının bir organizmanın DNA'sından izole edilip başka bir bakteriye aktarılması sürecidir. Bu süreç şu aşamalardan oluşur: 1. Genin İzolasyonu: İlgi duyulan gen, organizmanın DNA'sından çıkarılır. 2. Vektör Seçimi: İzole edilen gen, plazmid veya virüs gibi bir taşıyıcı (vektör) aracılığıyla bakteriye aktarılır. 3. Vektör ve Genin Birleştirilmesi: Restriksiyon enzimleri kullanılarak hem vektör hem de gen belirli noktalarından kesilir ve bu kesilme bölgeleri ligaz enzimleri ile birleştirilir. 4. Transformasyon: Birleştirilen DNA parçaları bakterilere aktarılır. 5. Seçim ve Analiz: Transformasyondan sonra, başarılı bir şekilde gen almış bakterilerin seçimi yapılır ve bu bakteriler PCR veya restriksiyon analizi gibi yöntemlerle test edilir. 6. Ekspresyon ve Karakterizasyon: Klonlanan genin bakterilerde protein olarak ifade edilmesi sağlanır ve ürünler biyokimyasal analizler ile karakterize edilir.