Kimerizmin nedenleri çeşitli şekillerde ortaya çıkabilir: 1. Embriyonik Gelişim: Gebeliğin çok erken evrelerinde iki ayrı embriyonun birleşmesi, tek bir birey haline gelmesi. 2. Genetik Mutasyonlar: Farklı zigotlardan çoğalan hücrelerin tek bir organizma oluşturması. 3. Tıbbi Müdahaleler: Kemik iliği nakli, kan transfüzyonu veya kök hücre nakli gibi işlemler sırasında verici hücrelerin alıcıya geçmesi. 4. Anne ve Fetüs Arasında Alışveriş: Hamilelik sırasında anne ile fetüs arasında hücre alışverişi gerçekleşmesi, mikrokimerizme yol açar. Bu durumlar, bireyin vücudunda iki farklı DNA seti bulunmasına neden olur.