İskitlerin kökeni hakkında farklı görüşler bulunmaktadır: İran kökenli oldukları ve İran dilinin İskit kolunu konuştukları düşünülmektedir. Hint-Avrupa kökenli bir kavim oldukları ve dil ile din açısından Perslerle ilişkili oldukları öne sürülmektedir. Slav veya Ural-Altay kökenli oldukları nazariyeleri de ortaya atılmıştır. İskitlerin anayurdu konusunda da farklı görüşler vardır. Herodot, İskitler'in Orta Asya'dan geldiğini belirtirken, bazı araştırmacılar Karadeniz'den veya Srubna kültürü gibi yerel gruplardan ortaya çıktıklarını öne sürmektedir. İskitlerin kökeni ve anayurdu konusunda kesin bir görüş birliğine varılamamıştır.