İlk hücrenin nasıl meydana geldiği kesin olarak bilinmemekle birlikte, hücrenin kökenine dair bazı teoriler bulunmaktadır: 1. Kendiliğinden Oluşum Teorisi: İlk canlı organizmaların, Yerküre atmosferinde var olduğu düşünülen koşullarda, basit organik moleküllerin kendiliğinden oluşması ve bu moleküllerin zamanla karmaşık yapılar haline gelmesiyle ortaya çıktığı düşünülmektedir. 2. Hücre Teorisi: Theodor Schwann ve Matthias Schleiden tarafından ortaya atılan bu teoriye göre, tüm canlılar hücrelerden oluşur ve bu hücreler var olan diğer hücrelerin bölünmesiyle meydana gelir. Ayrıca, elektron mikroskobunun icadı ve gelişmiş görüntüleme teknolojileri, hücrelerin daha ayrıntılı incelenmesini sağlayarak bu konudaki bilgilerin artmasına katkıda bulunmuştur.