İki çekirdekli kayısı, genetik eğilim veya beslenme fizyolojisi nedeniyle oluşabilir . Ayrıca, bazı kayısı çeşitlerinde çift dişi organ oluşumu da görülebilir ve bu durum yüksek sıcaklıklar nedeniyle tomurcukların ayrım periyotlarında ortaya çıkabilir .