Fatih dönemi ile II. Bayezid dönemi arasındaki bazı farklar şunlardır: Yönetim Anlayışı: Fatih Sultan Mehmed, devlet-padişah özdeşliğine dayanan bir anlayış benimserken, II. Bayezid döneminde bu anlayış eleştirilmiş ve bazı uygulamalar değiştirilmiştir. Adalet Algısı: II. Bayezid, "devr-i sâbık" olarak kabul edilen Fatih Sultan Mehmed dönemini adaletsizlikle eleştirmiş ve bu dönemi sorgulayan bir yönetim anlayışı benimsemiştir. Dış Politika: II. Bayezid döneminde Osmanlı Devleti, batıyla münasebetlerde daha durgun bir dönem geçirmiş, ancak güçlü bir Osmanlı donanmasının altyapısı bu dönemde oluşturulmuştur. Askeri Faaliyetler: II. Bayezid'in tahtta kaldığı süre, Fatih Sultan Mehmed ile neredeyse eşit olmasına rağmen, II. Bayezid yalnız beş kez sefere çıkmıştır. Halkla İlişkiler: Fatih'in yüksek vergi politikaları ve bitmek tükenmek bilmeyen seferleri, halk ve yeniçeriler arasında memnuniyetsizliğe yol açmış, II. Bayezid'in daha yumuşak huylu olması bu gerginliği bir nebze azaltmıştır.