Hücre döngüsünde kontrol noktaları, hücre döngüsünün farklı evrelerinde bulunan ve önceki olayların tamamlanıp tamamlanmadığını kontrol eden noktalardır. Hücre döngüsünde üç ana kontrol noktası vardır: G1, G2 ve M kontrol noktaları: 1. G1 kontrol noktası: Hücrenin yeterli büyüklüğe ulaşıp ulaşmadığını, yeterli besine sahip olup olmadığını ve DNA'nın hasar görüp görmediğini kontrol eder. 2. G2 kontrol noktası: Replike olmamış ve hasarlı DNA'yı kontrol eder, ayrıca hücrenin büyüklüğünü kontrol eder. 3. M kontrol noktası: İğ ipliği oluşumunu kontrol eder, kromozomların mitotik ipliklere düzgün bir şekilde tutunup tutunmadığını denetler.