Halil İnalcık'ın en önemli eseri olarak şunlar gösterilebilir: "The Ottoman Empire The Classical Age 1300-1600". "An Economic and Social History of the Ottoman Empire" (Donald Quataert ile birlikte). "Osmanlı'da Devlet, Hukuk, Adalet". "Osmanlı İmparatorluğu'nun Ekonomik ve Sosyal Tarihi Cilt 1/2". "Devlet-i 'Aliyye: Tagayyür ve Fesad". Ayrıca, İnalcık'ın "Tanzimat ve Bulgar Meselesi" ve "Fatih Devri Üzerinde Tetkikler ve Vesikalar" gibi eserleri de önemli çalışmaları arasında yer alır.