H2O ve H2S moleküllerinin farklı geometrilere sahip olmasının temel nedeni, oksijen ve kükürt atomlarının elektronegatiflik farklarıdır. H2O molekülü: Oksijen, hidrojenden daha yüksek elektronegatifliğe sahiptir (yaklaşık 2,3). Yalnız çiftler, komşu su molekülleriyle hidrojen bağları oluşturur. H2S molekülü: Kükürt, hidrojenden daha düşük elektronegatifliğe sahiptir (yaklaşık 0,5). Kükürt atomunun yalnız çiftleri, sp3 ve d orbitallerinde delokalize olur. Sonuç olarak, su molekülleri arasındaki hidrojen bağları daha güçlü iken, hidrojen sülfür molekülleri arasındaki çekim kuvvetleri daha zayıftır.