Gemi işletme mühendisi, gemilerin güvenli bir şekilde işletilmesi ve makinelerinin bakımı ile ilgili çeşitli görevleri yerine getirir. Bu görevler arasında: Geminin çalıştırılması: Geminin motor, kazan ve jeneratör gibi ana makinelerinin işletilmesi. Yüklerin teslim edilmesi: Yüklerin ilgili limana teslim edilmesinin sağlanması. Teknik ve yönetim iletişimi: Teknik kadrolar ile yönetim kadroları arasında iletişimin sağlanması. Bakım ve onarım: Gemilerde periyodik bakım planlarının yapılması, arızaların teşhis edilmesi ve onarımların koordine edilmesi. Ayrıca, gemi işletme mühendisleri, deniz taşımacılığı şirketlerinde, tersanelerde ve denizcilikle ilgili diğer işletmelerde de çalışabilirler.