GDO'nun yasaklanma nedenleri şunlardır: 1. İnsan, hayvan ve bitki sağlığı: GDO ve ürünlerinin çevreye ve biyolojik çeşitliliğe zarar verme potansiyeli taşıması. 2. Tüketici tercih hakkı: GDO'lu ürünlerin kullanımının, üreticinin tüketicinin tercih hakkını ortadan kaldırması. 3. Ekolojik denge: GDO'lu bitkilerin, doğal bitki türlerini yok ederek ekosistemi bozabilmesi. 4. Yasal düzenlemeler: Biyogüvenlik Kanunu ile GDO'lu ürünlerin ithalatı, ihracatı ve piyasaya sürülmesi gibi faaliyetlerin risk değerlendirmesine tabi tutulması.