Antijen, vücuda girdiğinde bağışıklık sistemi tarafından antikor üretimine yol açan yabancı moleküllerdir. Antijenler genellikle protein ve polisakkarit yapısında olup, canlı organizma bölümleri veya büyük moleküllü proteinler ve bunlara bağlanmış karbonhidratlar, nükleik, lipidik kısımları ya da ürünleridir. Antijenlerin bazı türleri: Eksojen antijenler: Bakteri, virüs ve mantar gibi mikroorganizmalar veya bunların salgıladığı toksinler. Endojen antijenler: Hücre içinde üretilen ve hücrenin yüzeyine sunulan antijenler. Otoantijenler: Vücudun kendi hücreleri. Allerjenler: Alerjik tepkileri tetikleyen antijenler. Tümör antijenleri: Kanser hücrelerinde bulunan antijenler. Transplantasyon antijenleri: Organ nakillerinde uyumluluğu belirleyen antijenler. Antijenler, bağışıklık sistemini tetikleyerek savunma mekanizmalarını harekete geçirir ve enfeksiyonların teşhisinde kullanılır.