Eksozomlar, vücuttaki tüm hücreler tarafından üretilir. Üretim süreci şu şekilde gerçekleşir: 1. Hücre zarının bir bölümü hücre içine alınır (endositoz). 2. Bu zar tekrar kendi içine kıvrılarak küçük bir kesecik oluşturur (intraluminal kesecik). 3. Bu kesecikler, hücre içi metabolik süreçlerde yer alan DNA, miRNA, mRNA, çeşitli proteinler ve büyüme faktörlerini içerir. 4. "Multiveziküler cisimcik" (MVB) olarak adlandırılan ve içerisinde çok sayıda kesecik barındıran bir yapı oluşur. 5. MVB'ler plazma zarıyla birleşir ve içeriği hücrenin dışına atılır, bu kesecikler "eksozom" olarak adlandırılır. Eksozomlar ayrıca kan, idrar, ağız içi salgı, amniyotik sıvı, beyin-omurilik sıvısı, eklem sıvısı, nazal salgılar, anne sütü, serum ve plazma gibi vücut sıvılarında da bulunur.