Gıda mühendisliği iki ana bölüme ayrılır: Gıda Bilimleri ve Gıda Teknolojileri. Gıda Bilimleri dalı, kendi içinde şu bilim dallarını içerir: - gıda kimyası; - gıda mikrobiyolojisi; - gıda kalite kontrolü; - beslenme. Gıda Teknolojileri dalı ise şu bilim dallarını kapsar: - gıda mühendisliği temel işlemleri; - yağ teknolojisi; - meyve-sebze teknolojisi; - hububat teknolojisi; - süt teknolojisi; - et teknolojisi; - gıda maddelerinin ambalajlanması; - biyoteknoloji; - gıda ekonomisi ve endüstrisi işletmeciliği.