Cinsiyet ve cinsiyet kimliği arasındaki temel fark, cinsiyetin biyolojik, fizyolojik ve genetik boyutları ifade ederken, cinsiyet kimliğinin bireyin kendini hangi cinsiyet olarak tanımladığını ve hissettiğini ifade etmesidir. Cinsiyet, bir canlının doğuştan, genetik olarak kazandığı, cinsel üremeye yönelik özelliklerin toplamıdır ve genellikle erkek, dişi veya interseks olarak sınıflandırılır. Cinsiyet kimliği ise, bir kişinin kendini kadın, erkek, her iki cinsiyetin bir karışımı, hiçbiri veya başka bir cinsiyet kimliği olarak görmesiyle ilgilidir ve bu kişisel bir deneyimdir.