Çene gamzesi, genellikle genetik faktörler nedeniyle oluşur. Çene gamzesinin oluşma nedenleri arasında şunlar da bulunur: Embriyonun gelişim döneminde çene kemiğinin ve çene etrafındaki kasların sağ ve sol bölümlerinin düzgün şekilde birleşmemesi. Zygomaticus major kasının, gamzeli olmayan kişilerdekine göre daha kısa olması. Çene gamzesi, bazen doğum sırasında gerçekleşen bir mutasyon sonucu da ortaya çıkabilir. Çene gamzesi, estetik bir sorun olarak kabul edilse de, genellikle sağlık açısından bir sorun teşkil etmez.