Çekirdeğin içinde ökaryot hücrelerde bulunan hücreler şunlardır: 1. Kromatin: DNA ve özel proteinlerin birleşmesinden oluşur, hücre bölünmesi sırasında kromozomları oluşturur. 2. Çekirdekçik (Nükleolus): Ribozomal RNA (rRNA) sentezinin gerçekleştiği ve ribozomların üretildiği yerdir. 3. Çekirdek Plazması (Nükleoplazma): Çekirdeğin içini dolduran sıvıdır, DNA, RNA ve çeşitli molekülleri barındırır. Prokaryot hücrelerde ise zarla çevrili bir çekirdek bulunmaz, genetik materyal sitoplazmada serbest hâlde yer alır.