Vakuolar sistem, bir hücrenin sitoplazmasında bulunan vakuoller, tübüller ve endoplazmik retikulum gibi yapıları içeren bir topluluktur. Vakuolar sistemin işlevleri: Metabolizmanın düzenlenmesi. Hücre içindeki maddelerin taşınmasının düzenlenmesi. Hücre yapısının oluşumu ve korunmasında rol oynama. Vakuoller, hücre içinde sıvıyla dolu boşluklardır ve proteinler, lipitler, karbonhidratlar gibi çeşitli maddeleri içerirler.