III. Murad, 48 yaşında, 20 yıllık saltanatının ardından 16 Ocak 1595'te felç geçirerek vefat etmiştir. Bazı tarihçilere göre, III. Murad kendini zevke, tasavvufa ve şiire verdiği için devlet işleri ihmal edilmiş ve bu durum, Sokullu Mehmed Paşa'nın ölümünden sonra devlet yönetiminde istikrarsızlığa yol açarak imparatorluğun duraklama dönemine girmesine neden olmuştur.