Ankara 29 Mayıs Devlet Hastanesi'nde aşağıdaki bölümler bulunmaktadır: Cerrahi Bölümler: Anestezi ve Reaminasyon, Beyin ve Sinir Cerrahisi, Çocuk Cerrahi, Genel Cerrahi, Göz Sağlığı ve Hastalıkları, Kadın Hastalıkları, Kalp ve Damar Cerrahisi, Kulak Burun Boğaz, Ortopedi ve Travmatoloji, Tıbbi Patoloji, Üroloji. Dahili Bölümler: Deri ve Zührevi Hastalıklar, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Enfeksiyon Hastalıkları, Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon, Göğüs Hastalıkları, İç Hastalıkları, Kardiyoloji, Nöroloji, Psikiyatri.