Marmara Üniversitesi'nde 103 bölüm bulunmaktadır ve bu bölümler 22 farklı fakültede yer almaktadır. Bazı fakülteler ve bölümleri şunlardır: Atatürk Eğitim Fakültesi: Bilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Öğretmenliği, Özel Eğitim Öğretmenliği, Rehberlik ve Psikolojik Danışmanlık. Fen-Edebiyat Fakültesi: Alman Dili ve Edebiyatı, Bilgi ve Belge Yönetimi, Biyoloji, Coğrafya, Felsefe, Fizik, İstatistik, Kimya, Matematik. İktisat Fakültesi: Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri, Ekonometri, Maliye, İktisat. İşletme Fakültesi: İşletme, Yönetim Bilişim Sistemleri. Sağlık Bilimleri Fakültesi: Beslenme ve Diyetetik, Ebelik, Fizyoterapi ve Rehabilitasyon, Hemşirelik. Mühendislik Fakültesi: Bilgisayar Mühendisliği, Biyomühendislik, Çevre Mühendisliği, Elektrik-Elektronik Mühendisliği, Endüstri Mühendisliği. İletişim Fakültesi: Gazetecilik, Halkla İlişkiler ve Tanıtım, Radyo, Televizyon ve Sinema. Hukuk Fakültesi: Hukuk. İlahiyat Fakültesi: İlahiyat, İlahiyat (M.T.O.K.).