2025-2026 sezonunda 3. Lig'de oynanacak format şu şekildedir: Gruplar: 64 takım, 16'lı 4 grupta yer alır. Normal Sezon: Gruplarda 1. sırayı alan 4 takım doğrudan 2. Lig'e yükselir. Play-Off: Gruplarda 2., 3., 4., 5. ve 6. sırada yer alan takımlar play-off oynar. Play-Off Eşleşmeleri: İlk turda 3. ile 6., 4. ile 5. karşılaşır. İkinci turda, ilk turu geçen takımlar, ligi 2. sırada tamamlayanlarla oynar. Üçüncü turda, ikinci turu geçen takımlar karşılaşır. Finalde, 1. Grup ile 2. Grup, 3. Grup ile 4. Grup eşleşerek tarafsız sahada tek maç oynar. Yükselme: Finalleri kazanan 2 takım, 2. Lig'e yükselir. Düşme: Tüm gruplarda son 4 sırayı alan toplam 16 takım bir sonraki sezon Bölgesel Amatör Lig'e düşer.