Atlı Köşk'ün içinde Sakıp Sabancı Müzesi'nde şu bölümler bulunmaktadır: 1. Kitap Sanatları ve Hat Koleksiyonu: El yazması Kuran-ı Kerimler, kıt'a, levha, murakka, dua kitapları, tuğralar, beratlar ve fermanlar gibi Osmanlı hat sanatının önemli eserleri yer alır. 2. Resim Koleksiyonu: 19. ve 20. yüzyıla ait resimler, Osman Hamdi Bey, İzzet Ziya, Şevket Dağ, Süleyman Seyyid, Fikret Mualla, Bedri Rahmi Eyüboğlu gibi ünlü sanatçıların eserlerini içerir. 3. Mobilya ve Dekoratif Eşyalar Koleksiyonu: Bohemya kristallerinden avizeler, antika vazolar, şamdanlar, halılar gibi Osmanlı döneminden birçok eser sergilenir. 4. Arkeolojik Eserler: Roma, Bizans ve Osmanlı dönemlerinden arkeolojik ve taş eserler müzenin bahçesinde yer alır. Ayrıca, müzede geçici sergiler, konferanslar, eğitim programları ve kültür-sanat etkinlikleri de düzenlenmektedir.