Shounen ve shoujo arasındaki temel farklar şunlardır: Hedef kitle: Shounen, genç erkek izleyicilere; shoujo ise genç kadın izleyicilere yöneliktir. Hikaye türü: Shounen serileri aksiyon, savaş ve rekabet odaklıyken; shoujo serileri romantizm, duygusal büyüme veya kişiler arası ilişkilere odaklanır. Görsel stil: Shounen animeleri canlı renkler, dinamik aksiyon sahneleri ve kaslı karakterlerle; shoujo animeleri ise yumuşak renkler, zarif çizimler ve duygusal anları vurgulayan estetiklerle tanınır. Bu ayrımlar, 1900'lerin başından beri tutarlı bir şekilde sürmektedir.