Canon EOS ve Canon EOS 6D arasındaki bazı farklar: Megapiksel: Canon EOS 6D, 24,1 MP'ye karşı Canon EOS'un 20,2 MP'dir. Video kaydı: Canon EOS 6D, 2160 x 25 fps'ye karşı 1080 x 30 fps video kaydı yapabilir. Kablosuz şarj: Canon EOS 6D'de kablosuz şarj özelliği bulunmaz. Optik görüntü dengeleyici: Canon EOS 6D'de optik görüntü dengeleyici yoktur. Sensör boyutu: Canon EOS 6D, 22,3 x 14,9 mm sensöre karşı 36 x 24 mm sensöre sahiptir. Seri çekim modu: Canon EOS 6D, 4,5 fps'ye karşı 5 fps seri çekim yapabilir. Çift kart yuvası: Canon EOS 6D'de çift kart yuvası bulunmaz. Ayrıca, Canon EOS 6D'nin hava sızdırmazlığı (weather-sealed) özelliği bulunurken, Canon EOS'ta bu özellik yoktur.