Gebze'den Marmaray ile gidilebilecek bazı yerler: Halkalı: Gebze'den Marmaray'a binildiğinde, Avrupa Yakası'na geçilerek en batıdaki durak olan Halkalı'ya kadar gidilebilir. Pendik, Maltepe, Bostancı, Kadıköy, Üsküdar: Marmaray hattı, Anadolu Yakası'nda bu semtlere kolayca ulaşım sağlar. Ankara Hızlı Tren Garı ve diğer şehirlerarası trenler: Pendik'te aktarma yaparak bu yerlere ulaşılabilir. Gebze'den Marmaray ile tam hat yolculuğu yaklaşık 1 saat 40 dakika ile 2 saat arasında sürer.