En iyi Fuji elması çeşitleri arasında öne çıkanlar şunlardır: 1. Fuji Zhen Aztec: Japonya kökenli, iri, canlı kırmızı üzerine sarı benekli, sert, sulu ve çok lezzetli bir çeşittir. 2. Red Fuji: Daha koyu kırmızı renkli olup, standart Fuji elmasından daha tatlıdır. 3. Shinano Sweet: Daha yuvarlak şekilli ve tatlı bir lezzet profiline sahiptir. Ayrıca, Fuji Gala çeşidi de Fuji ve Gala elmasının melezlenmesiyle elde edilmiş olup, ince kabuklu ve hafif ekşi bir tada sahiptir.