Saksağanlar, çeşitli tehlikelerden korkar: Yırtıcı hayvanlar: Kartal, şahin, kedi, köpek, tilki gibi yırtıcı türler saksağanları avlayabilir. İklim koşulları: Aşırı hava durumları, özellikle soğuk kışlar, yiyecek bulmayı zorlaştırır. İnsan faaliyetleri: Kentsel gelişim, tarım alanlarının açılması ve tarım ilaçları saksağanların yaşam alanlarını tehdit eder. Hastalıklar ve parazitler: Viral ve bakteriyel hastalıklar ile iç ve dış parazitler saksağanların sağlığını olumsuz etkiler. Ayrıca, parlak nesneler de saksağanları rahatsız eder; bu nedenle çiftçiler, saksağanları uzak tutmak için tarlalara parlak nesneler yerleştirir.