AKTS, Avrupa Kredi Transfer Sistemi'nin kısaltmasıdır ve Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi'nde bir dersin öğrencilere kazandırdığı yetkinlikleri (teorik ders, uygulama, seminer, bireysel çalışma, staj, proje hazırlama, sınavlar, ödevler vb.) esas alarak hesaplanır. Üniversitede ikili kredilendirme sistemi uygulanmaktadır; AKTS sistemine paralel olarak ulusal kredilendirme sistemi de kullanılmaktadır. Bazı AKTS hesaplama prensipleri: Kredilendirme sistemi yıllık 60 AKTS üzerinden hesaplanır. Yılda iki dönem olduğunda, dönem başına 30 AKTS; üç dönem olduğunda ise dönem başına 20 AKTS üzerinden hesaplama yapılır. Dört yıllık programlarda toplam 240 AKTS, iki yıllık programlarda toplam 120 AKTS, üç yıllık programlarda toplam 180 AKTS hesaplanır.