Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü'nde (günümüzdeki adıyla Gebze Teknik Üniversitesi) aşağıdaki bölümler bulunmaktadır: Lisans Bölümleri: Uçak Mühendisliği, Matematik, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Mimarlık, Malzeme Bilimi ve Mühendisliği, Makine Mühendisliği, Kimya, Kimya Mühendisliği, İktisadi İdari Bilimler, İnşaat Mühendisliği, İşletme, Harita Mühendisliği, Fizik, Elektronik Mühendisliği, Endüstri Mühendisliği, Çevre Mühendisliği, Bilgisayar Mühendisliği, Biyomühendislik. Yüksek Lisans Programları: Bilgisayar Mühendisliği, Çevre Mühendisliği, Deprem ve Yapı Mühendisliği, Ekonomi (İktisat), Elektronik Mühendisliği, Fizik, Girişimcilik ve Yenilik Yönetimi, Jeodezi ve Fotogrametri Mühendisliği, Kimya Mühendisliği, Kimya, Makine Mühendisliği, Malzeme Bilimi ve Mühendisliği, Matematik, MBA (İşletme), Mimarlık, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Strateji Bilimi, Şehir ve Bölge Planlama, Uluslararası Ticaret ve Finans.