Zirve Muhasebe Programı, kullanıcı dostu arayüzü ve basit işlevselliği sayesinde genellikle zor olarak değerlendirilmez. Ancak, programın bazı dezavantajları da bulunmaktadır: - Büyük ölçekli işletmeler için yetersiz kalabilir ve özellikleri sınırlı olabilir. - Entegrasyon seçenekleri kısıtlı olup, diğer yazılımlarla uyum sorunları yaşanabilir. - Teknik destek ve güncellemeler konusunda zaman zaman gecikmeler olabilir. Programın kullanımı, kullanıcının eğitim seviyesine ve önceki deneyimlerine bağlı olarak değişebilir.