Ters osmoz ile su arıtmanın bazı dezavantajları şunlardır: Su israfı: Ters osmoz sistemleri, arıtılan her litre su için 3-5 litre atık su üretir, bu da çevresel ve ekonomik bir dezavantajdır. Mineral kaybı: Su içindeki kalsiyum, magnezyum, potasyum gibi faydalı mineraller ile florür uzaklaştırılır, bu da suyun mineral dengesini bozabilir. Yüksek maliyet: Kurulum ve bakım maliyetleri diğer su filtrasyon sistemlerine göre daha yüksektir. Alışılmadık tat: Minerallerin uzaklaştırılması, suyun düz bir tada sahip olmasına veya balık kokusu içermesine neden olabilir. Dehidrasyon riski: Elektrolit içermeyen ve daha asidik olan ters osmoz suyu, vücudu yeterince hidratlamayabilir. Onarım ve bakım gerekliliği: Membran ve filtrelerin düzenli olarak değiştirilmesi gerekir, aksi takdirde sistem arızalanabilir.