Canon EOS R6 ve R6 Mark II arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Megapiksel Sayısı: R6 Mark II, 24.2 megapiksel sensöre sahipken, R6'nın sensörü 20.1 megapikseldir. 2. Sürekli Çekim Hızı: R6 Mark II, elektronik deklanşörle 40 fps'ye kadar çekim yapabilirken, R6'da bu hız 20 fps'dir. 3. Video Özellikleri: R6 Mark II, 6K ProRes RAW video kaydı yapabilir ve 30 dakikalık kayıt limitini kaldırmıştır. 4. AF Özellikleri: R6 Mark II, daha hızlı ve daha geniş bir yelpazede (insanlar, kediler, köpekler, kuşlar, arabalar vb.) otomatik odaklama yapabilir. 5. Batarya Ömrü: R6 Mark II, daha uzun batarya ömrüne sahiptir; LCD güç tasarrufu modunda 760, EVF güç tasarrufu modunda ise 450 çekim yapabilir. 6. Tasarım: R6 Mark II'de güç düğmesi, sağ taraftaki kontrol kadranının altına taşınmış ve hala kullanılabilir durumda olan R6'nın yerine sol tarafa bir hala/video modu kolu eklenmiştir.