Derin kuyu, yer altı su seviyesi adi kuyulardan fazla olan kuyulardır. Bu tür kuyular, genellikle içme suyu elde etmek, jeotermal enerji elde etmek, petrol ve doğalgaz aramak, madencilik faaliyetlerinde bulunmak gibi çeşitli amaçlar için kullanılır. Derin kuyuların inşası, jeolojik yapının incelenmesini, doğru sondaj tekniklerinin kullanılmasını ve su kalitesinin düzenli olarak kontrol edilmesini gerektirir.